在做试管婴儿移植前，通常需要使用促排卵药物来刺激卵巢产生多个卵泡，由此推进增加可利用的成熟卵子数量。
这一过程可能致使子宫内膜发生变化，如增厚或改变其结构，为胚胎着床创造更有利的条件。反之过度的药物使用有时会招致子宫内膜过厚或过薄，影响胚胎的着床率。除此之外长期或频繁的激素治疗可能会影响子宫内膜的正常周期性变化，进而影响月经周期。尽管试管婴儿过程中采取了严格的无菌操作，但任何侵入性操作都有可能引入细菌，招致感染。子宫内膜炎是最常见的感染类型之一，表现为下腹痛、发热等症状，严重时可能需要抗生素治疗。感染不仅影响现阶段的妊娠成功率，还可能对未来的生育能力造成不利影响。
为了提高妊娠成功率，医生有时会移植多个胚胎，增加了多胎妊娠的风险。多胎妊娠比单胎妊娠面临更高的并发症风险，包括早产、低出生体重等，同步地也可能对母亲的身体造成更大的负担，尤其是子宫。多胎妊娠可能致使子宫过度扩张，增加产后出血、子宫脱垂等风险。试管婴儿过程往往伴随着较大的心理压力，这对女性的整体健康也有不可忽视的影响。长期的压力和焦虑状态可能影响内分泌系统，间接影响子宫健康，如月经紊乱、子宫肌瘤等。由此心理支持和调适同样重要，有助于提高试管婴儿的成功率和维护女性的身心健康。